Eugenio López-Cortegano
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近亲繁殖
Prediction of fitness under different breeding designs in conservation programs
计算机模拟用于测试在不同交配方式下种群中近交清除参数的估计:随机交配、循环交配和相等贡献。
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Genetic purging in captive endangered ungulates with extremely low effective population sizes
我们使用近亲繁殖-清除理论来估计濒危有蹄类动物($N_e$ < 40)的纯种种群的清除程度。 我们还推导出一个数学表达式来估计清除变为可检测所需的预期时间。
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purgeR: Inbreeding and purging in pedigreed populations
用于近亲繁殖和纯种种群清除分析的 R 包。迄今为止最完整的遗传清除分析工具,包括首次估计个体近交负荷下降的模型。
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Long-term exhaustion of the inbreeding load in Drosophila melanogaster
这项工作继续了先前对果蝇小种群($N_{e} \approx 50$)的较长时间的研究。 经过 100 多代实验,测得的近亲繁殖负荷几乎耗尽,与清除理论的预期一致。
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purgeR
谱系种群中近交清除遗传参数的估计。
Apr 30, 2021
CRAN
Optimal management of genetic diversity in subdivided populations
使用模拟种群通过两种不同的策略探索分散种群中的遗传多样性最大化:等位基因多样性的最大化或预期的杂合性。 我们的结果表明,增加等位基因多样性在减少种群近亲繁殖和保持种群适应潜力之间提供了更好的折衷。
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Metapop2
细分种群的基因和等位基因多样性分析,以及保护计划中的管理工具。
Apr 2, 2019
Metapop2: Re-implementation of software for the analysis and management of subdivided populations using gene and allelic diversity
Metapop2 是软件 Metapop 的重新实现,用于估计结构化种群中的基因和等位基因多样性成分,并协助管理建议(https://gitlab.com/elcortegano/metapop2)。
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Detection of genetic purging and predictive value of purging parameters estimated in pedigreed populations
导出计算祖先近亲繁殖 ($F_{a}$) 作为有效种群大小 ($N_{e}$) 的函数的表达式。 模拟用于显示使用基于 $F_{a}$ 和清除近亲繁殖 ($g$) 的模型检测和预测清除。
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Predictive model and software for inbreeding-purging analysis of pedigreed populations
推导出具有重叠世代的谱系中清除近交系数的近似值,并提供了估计种群中清除系数 ($d$) 的软件 (
https://gitlab.com/elcortegano/PURGd
)。
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